Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms