Protein–RNA interactions for Protein: Q00994

BEX3, Protein BEX3, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEX3Q00994 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BEX3Q00994 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BEX3Q00994 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
BEX3Q00994 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
BEX3Q00994 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
BEX3Q00994 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BEX3Q00994 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
BEX3Q00994 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BEX3Q00994 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BEX3Q00994 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BEX3Q00994 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BEX3Q00994 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BEX3Q00994 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BEX3Q00994 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BEX3Q00994 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BEX3Q00994 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BEX3Q00994 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BEX3Q00994 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BEX3Q00994 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BEX3Q00994 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BEX3Q00994 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BEX3Q00994 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BEX3Q00994 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BEX3Q00994 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BEX3Q00994 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BEX3Q00994 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BEX3Q00994 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BEX3Q00994 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BEX3Q00994 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BEX3Q00994 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BEX3Q00994 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BEX3Q00994 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BEX3Q00994 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BEX3Q00994 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BEX3Q00994 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BEX3Q00994 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
BEX3Q00994 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BEX3Q00994 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BEX3Q00994 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BEX3Q00994 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BEX3Q00994 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BEX3Q00994 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BEX3Q00994 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BEX3Q00994 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BEX3Q00994 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BEX3Q00994 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BEX3Q00994 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BEX3Q00994 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BEX3Q00994 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
BEX3Q00994 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BEX3Q00994 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BEX3Q00994 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BEX3Q00994 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BEX3Q00994 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BEX3Q00994 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BEX3Q00994 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BEX3Q00994 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BEX3Q00994 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BEX3Q00994 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
BEX3Q00994 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BEX3Q00994 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BEX3Q00994 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BEX3Q00994 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BEX3Q00994 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BEX3Q00994 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BEX3Q00994 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BEX3Q00994 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BEX3Q00994 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BEX3Q00994 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BEX3Q00994 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BEX3Q00994 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BEX3Q00994 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BEX3Q00994 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BEX3Q00994 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BEX3Q00994 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BEX3Q00994 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BEX3Q00994 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
BEX3Q00994 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BEX3Q00994 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
BEX3Q00994 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BEX3Q00994 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
BEX3Q00994 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
BEX3Q00994 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BEX3Q00994 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
BEX3Q00994 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BEX3Q00994 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BEX3Q00994 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BEX3Q00994 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BEX3Q00994 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BEX3Q00994 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BEX3Q00994 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BEX3Q00994 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BEX3Q00994 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BEX3Q00994 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BEX3Q00994 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BEX3Q00994 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
BEX3Q00994 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
BEX3Q00994 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BEX3Q00994 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BEX3Q00994 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms