Protein–RNA interactions for Protein: P61247

RPS3A, 40S ribosomal protein S3a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP61247 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPS3AP61247 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPS3AP61247 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPS3AP61247 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPS3AP61247 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPS3AP61247 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPS3AP61247 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPS3AP61247 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPS3AP61247 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPS3AP61247 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPS3AP61247 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPS3AP61247 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPS3AP61247 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPS3AP61247 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPS3AP61247 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPS3AP61247 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPS3AP61247 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPS3AP61247 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPS3AP61247 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPS3AP61247 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPS3AP61247 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPS3AP61247 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPS3AP61247 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPS3AP61247 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RPS3AP61247 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPS3AP61247 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPS3AP61247 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPS3AP61247 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPS3AP61247 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPS3AP61247 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RPS3AP61247 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPS3AP61247 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RPS3AP61247 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPS3AP61247 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPS3AP61247 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPS3AP61247 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPS3AP61247 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPS3AP61247 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPS3AP61247 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPS3AP61247 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RPS3AP61247 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RPS3AP61247 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPS3AP61247 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RPS3AP61247 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPS3AP61247 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPS3AP61247 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPS3AP61247 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPS3AP61247 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPS3AP61247 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPS3AP61247 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPS3AP61247 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPS3AP61247 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPS3AP61247 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPS3AP61247 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPS3AP61247 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPS3AP61247 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPS3AP61247 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPS3AP61247 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPS3AP61247 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPS3AP61247 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPS3AP61247 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPS3AP61247 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RPS3AP61247 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPS3AP61247 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPS3AP61247 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPS3AP61247 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPS3AP61247 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPS3AP61247 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPS3AP61247 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPS3AP61247 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPS3AP61247 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPS3AP61247 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPS3AP61247 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPS3AP61247 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPS3AP61247 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPS3AP61247 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPS3AP61247 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPS3AP61247 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPS3AP61247 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPS3AP61247 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RPS3AP61247 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPS3AP61247 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPS3AP61247 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPS3AP61247 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPS3AP61247 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPS3AP61247 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPS3AP61247 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPS3AP61247 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPS3AP61247 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPS3AP61247 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPS3AP61247 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPS3AP61247 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPS3AP61247 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPS3AP61247 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPS3AP61247 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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