Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBASH3AP57075 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBASH3AP57075 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
UBASH3AP57075 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBASH3AP57075 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
UBASH3AP57075 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBASH3AP57075 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBASH3AP57075 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
UBASH3AP57075 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBASH3AP57075 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBASH3AP57075 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBASH3AP57075 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
UBASH3AP57075 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBASH3AP57075 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBASH3AP57075 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBASH3AP57075 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBASH3AP57075 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBASH3AP57075 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBASH3AP57075 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBASH3AP57075 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBASH3AP57075 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBASH3AP57075 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBASH3AP57075 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBASH3AP57075 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBASH3AP57075 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBASH3AP57075 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBASH3AP57075 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBASH3AP57075 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
UBASH3AP57075 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBASH3AP57075 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBASH3AP57075 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBASH3AP57075 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBASH3AP57075 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBASH3AP57075 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBASH3AP57075 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBASH3AP57075 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBASH3AP57075 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBASH3AP57075 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBASH3AP57075 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBASH3AP57075 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
UBASH3AP57075 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBASH3AP57075 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBASH3AP57075 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBASH3AP57075 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBASH3AP57075 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBASH3AP57075 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBASH3AP57075 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
UBASH3AP57075 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBASH3AP57075 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBASH3AP57075 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBASH3AP57075 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBASH3AP57075 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBASH3AP57075 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBASH3AP57075 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBASH3AP57075 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBASH3AP57075 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBASH3AP57075 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
UBASH3AP57075 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBASH3AP57075 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBASH3AP57075 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBASH3AP57075 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBASH3AP57075 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBASH3AP57075 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBASH3AP57075 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBASH3AP57075 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBASH3AP57075 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBASH3AP57075 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBASH3AP57075 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBASH3AP57075 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBASH3AP57075 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBASH3AP57075 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBASH3AP57075 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBASH3AP57075 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBASH3AP57075 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBASH3AP57075 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBASH3AP57075 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBASH3AP57075 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBASH3AP57075 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBASH3AP57075 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBASH3AP57075 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBASH3AP57075 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBASH3AP57075 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
UBASH3AP57075 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBASH3AP57075 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBASH3AP57075 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBASH3AP57075 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBASH3AP57075 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBASH3AP57075 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBASH3AP57075 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBASH3AP57075 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBASH3AP57075 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBASH3AP57075 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBASH3AP57075 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBASH3AP57075 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBASH3AP57075 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBASH3AP57075 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBASH3AP57075 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBASH3AP57075 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBASH3AP57075 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBASH3AP57075 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms