Protein–RNA interactions for Protein: P56545

CTBP2, C-terminal-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP2P56545 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms