Protein–RNA interactions for Protein: P55809

OXCT1, Succinyl-CoA:3-ketoacid coenzyme A transferase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OXCT1P55809 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
OXCT1P55809 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
OXCT1P55809 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
OXCT1P55809 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
OXCT1P55809 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
OXCT1P55809 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
OXCT1P55809 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
OXCT1P55809 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
OXCT1P55809 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
OXCT1P55809 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
OXCT1P55809 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
OXCT1P55809 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
OXCT1P55809 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
OXCT1P55809 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
OXCT1P55809 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
OXCT1P55809 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
OXCT1P55809 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
OXCT1P55809 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
OXCT1P55809 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
OXCT1P55809 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
OXCT1P55809 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
OXCT1P55809 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
OXCT1P55809 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
OXCT1P55809 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
OXCT1P55809 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
OXCT1P55809 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
OXCT1P55809 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
OXCT1P55809 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
OXCT1P55809 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
OXCT1P55809 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
OXCT1P55809 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
OXCT1P55809 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
OXCT1P55809 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
OXCT1P55809 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
OXCT1P55809 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
OXCT1P55809 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
OXCT1P55809 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
OXCT1P55809 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
OXCT1P55809 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
OXCT1P55809 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
OXCT1P55809 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
OXCT1P55809 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
OXCT1P55809 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
OXCT1P55809 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
OXCT1P55809 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
OXCT1P55809 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
OXCT1P55809 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
OXCT1P55809 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
OXCT1P55809 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
OXCT1P55809 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
OXCT1P55809 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
OXCT1P55809 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
OXCT1P55809 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
OXCT1P55809 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
OXCT1P55809 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
OXCT1P55809 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
OXCT1P55809 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
OXCT1P55809 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
OXCT1P55809 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
OXCT1P55809 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
OXCT1P55809 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
OXCT1P55809 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
OXCT1P55809 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
OXCT1P55809 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
OXCT1P55809 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
OXCT1P55809 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
OXCT1P55809 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
OXCT1P55809 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
OXCT1P55809 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
OXCT1P55809 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
OXCT1P55809 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
OXCT1P55809 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
OXCT1P55809 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
OXCT1P55809 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
OXCT1P55809 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
OXCT1P55809 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
OXCT1P55809 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
OXCT1P55809 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
OXCT1P55809 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
OXCT1P55809 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
OXCT1P55809 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
OXCT1P55809 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
OXCT1P55809 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
OXCT1P55809 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
OXCT1P55809 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
OXCT1P55809 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
OXCT1P55809 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
OXCT1P55809 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
OXCT1P55809 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
OXCT1P55809 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
OXCT1P55809 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
OXCT1P55809 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
OXCT1P55809 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
OXCT1P55809 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
OXCT1P55809 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
OXCT1P55809 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
OXCT1P55809 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
OXCT1P55809 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
OXCT1P55809 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
OXCT1P55809 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms