Protein–RNA interactions for Protein: P54764

EPHA4, Ephrin type-A receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 986 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA4P54764 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHA4P54764 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHA4P54764 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHA4P54764 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHA4P54764 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHA4P54764 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHA4P54764 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHA4P54764 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHA4P54764 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
EPHA4P54764 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
EPHA4P54764 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
EPHA4P54764 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
EPHA4P54764 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
EPHA4P54764 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHA4P54764 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHA4P54764 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHA4P54764 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHA4P54764 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHA4P54764 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHA4P54764 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHA4P54764 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHA4P54764 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHA4P54764 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHA4P54764 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHA4P54764 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHA4P54764 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHA4P54764 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHA4P54764 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHA4P54764 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHA4P54764 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHA4P54764 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHA4P54764 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHA4P54764 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHA4P54764 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHA4P54764 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHA4P54764 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHA4P54764 AC132872.1-201ENST00000566986 1195 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHA4P54764 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHA4P54764 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHA4P54764 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHA4P54764 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHA4P54764 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHA4P54764 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHA4P54764 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHA4P54764 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHA4P54764 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHA4P54764 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHA4P54764 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHA4P54764 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHA4P54764 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHA4P54764 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHA4P54764 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHA4P54764 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHA4P54764 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHA4P54764 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHA4P54764 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHA4P54764 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHA4P54764 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHA4P54764 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHA4P54764 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHA4P54764 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHA4P54764 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHA4P54764 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHA4P54764 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHA4P54764 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHA4P54764 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHA4P54764 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHA4P54764 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHA4P54764 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHA4P54764 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHA4P54764 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHA4P54764 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHA4P54764 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHA4P54764 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHA4P54764 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHA4P54764 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHA4P54764 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHA4P54764 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHA4P54764 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHA4P54764 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHA4P54764 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHA4P54764 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHA4P54764 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHA4P54764 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHA4P54764 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHA4P54764 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHA4P54764 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHA4P54764 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHA4P54764 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHA4P54764 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHA4P54764 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHA4P54764 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHA4P54764 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHA4P54764 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHA4P54764 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHA4P54764 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHA4P54764 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHA4P54764 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHA4P54764 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHA4P54764 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms