Protein–RNA interactions for Protein: P49759

CLK1, Dual specificity protein kinase CLK1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK1P49759 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLK1P49759 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CLK1P49759 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLK1P49759 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLK1P49759 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLK1P49759 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLK1P49759 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLK1P49759 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLK1P49759 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLK1P49759 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CLK1P49759 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CLK1P49759 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLK1P49759 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLK1P49759 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLK1P49759 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLK1P49759 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLK1P49759 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLK1P49759 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLK1P49759 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CLK1P49759 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLK1P49759 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLK1P49759 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLK1P49759 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLK1P49759 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLK1P49759 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CLK1P49759 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CLK1P49759 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CLK1P49759 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CLK1P49759 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLK1P49759 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLK1P49759 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLK1P49759 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLK1P49759 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLK1P49759 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLK1P49759 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLK1P49759 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLK1P49759 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLK1P49759 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLK1P49759 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLK1P49759 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CLK1P49759 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLK1P49759 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLK1P49759 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CLK1P49759 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLK1P49759 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLK1P49759 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLK1P49759 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLK1P49759 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLK1P49759 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLK1P49759 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLK1P49759 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLK1P49759 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLK1P49759 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLK1P49759 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CLK1P49759 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CLK1P49759 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLK1P49759 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLK1P49759 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLK1P49759 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CLK1P49759 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLK1P49759 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLK1P49759 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLK1P49759 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLK1P49759 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLK1P49759 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLK1P49759 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLK1P49759 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLK1P49759 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CLK1P49759 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CLK1P49759 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLK1P49759 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLK1P49759 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLK1P49759 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLK1P49759 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLK1P49759 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLK1P49759 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLK1P49759 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLK1P49759 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLK1P49759 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLK1P49759 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLK1P49759 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLK1P49759 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLK1P49759 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLK1P49759 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLK1P49759 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLK1P49759 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLK1P49759 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLK1P49759 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLK1P49759 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLK1P49759 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLK1P49759 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLK1P49759 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLK1P49759 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLK1P49759 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLK1P49759 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLK1P49759 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLK1P49759 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLK1P49759 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CLK1P49759 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLK1P49759 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms