Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms