Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TMPOP42166 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TMPOP42166 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
TMPOP42166 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TMPOP42166 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
TMPOP42166 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
TMPOP42166 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TMPOP42166 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TMPOP42166 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TMPOP42166 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TMPOP42166 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TMPOP42166 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TMPOP42166 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TMPOP42166 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TMPOP42166 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TMPOP42166 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TMPOP42166 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TMPOP42166 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TMPOP42166 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TMPOP42166 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMPOP42166 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMPOP42166 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMPOP42166 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMPOP42166 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMPOP42166 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMPOP42166 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMPOP42166 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMPOP42166 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMPOP42166 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMPOP42166 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMPOP42166 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMPOP42166 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMPOP42166 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMPOP42166 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMPOP42166 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMPOP42166 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMPOP42166 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMPOP42166 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMPOP42166 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMPOP42166 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMPOP42166 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMPOP42166 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
TMPOP42166 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMPOP42166 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
TMPOP42166 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMPOP42166 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMPOP42166 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMPOP42166 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMPOP42166 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMPOP42166 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMPOP42166 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMPOP42166 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMPOP42166 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMPOP42166 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMPOP42166 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMPOP42166 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMPOP42166 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMPOP42166 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMPOP42166 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMPOP42166 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMPOP42166 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMPOP42166 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMPOP42166 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMPOP42166 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMPOP42166 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMPOP42166 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMPOP42166 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMPOP42166 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
TMPOP42166 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
TMPOP42166 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMPOP42166 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
TMPOP42166 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMPOP42166 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMPOP42166 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMPOP42166 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMPOP42166 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMPOP42166 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMPOP42166 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMPOP42166 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMPOP42166 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMPOP42166 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMPOP42166 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMPOP42166 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMPOP42166 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMPOP42166 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMPOP42166 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMPOP42166 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMPOP42166 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMPOP42166 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMPOP42166 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMPOP42166 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMPOP42166 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMPOP42166 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMPOP42166 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
TMPOP42166 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMPOP42166 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMPOP42166 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMPOP42166 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMPOP42166 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMPOP42166 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
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