Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms