Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.4 ms