Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CASQ1P31415 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CASQ1P31415 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CASQ1P31415 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CASQ1P31415 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CASQ1P31415 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CASQ1P31415 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CASQ1P31415 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CASQ1P31415 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CASQ1P31415 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CASQ1P31415 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CASQ1P31415 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CASQ1P31415 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CASQ1P31415 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CASQ1P31415 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CASQ1P31415 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CASQ1P31415 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CASQ1P31415 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms