Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms