Protein–RNA interactions for Protein: P29508

SERPINB3, Serpin B3, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINB3P29508 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SERPINB3P29508 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SERPINB3P29508 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SERPINB3P29508 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SERPINB3P29508 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SERPINB3P29508 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SERPINB3P29508 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SERPINB3P29508 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SERPINB3P29508 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SERPINB3P29508 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SERPINB3P29508 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SERPINB3P29508 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SERPINB3P29508 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SERPINB3P29508 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SERPINB3P29508 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SERPINB3P29508 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SERPINB3P29508 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SERPINB3P29508 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SERPINB3P29508 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SERPINB3P29508 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SERPINB3P29508 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SERPINB3P29508 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SERPINB3P29508 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SERPINB3P29508 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SERPINB3P29508 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SERPINB3P29508 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SERPINB3P29508 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SERPINB3P29508 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SERPINB3P29508 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SERPINB3P29508 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SERPINB3P29508 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SERPINB3P29508 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SERPINB3P29508 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SERPINB3P29508 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SERPINB3P29508 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SERPINB3P29508 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SERPINB3P29508 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SERPINB3P29508 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SERPINB3P29508 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SERPINB3P29508 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SERPINB3P29508 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SERPINB3P29508 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SERPINB3P29508 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SERPINB3P29508 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SERPINB3P29508 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SERPINB3P29508 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SERPINB3P29508 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SERPINB3P29508 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SERPINB3P29508 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SERPINB3P29508 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SERPINB3P29508 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SERPINB3P29508 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SERPINB3P29508 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SERPINB3P29508 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SERPINB3P29508 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERPINB3P29508 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERPINB3P29508 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERPINB3P29508 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERPINB3P29508 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERPINB3P29508 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERPINB3P29508 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERPINB3P29508 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SERPINB3P29508 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SERPINB3P29508 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SERPINB3P29508 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERPINB3P29508 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERPINB3P29508 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SERPINB3P29508 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERPINB3P29508 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERPINB3P29508 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERPINB3P29508 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERPINB3P29508 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERPINB3P29508 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERPINB3P29508 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERPINB3P29508 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERPINB3P29508 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERPINB3P29508 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERPINB3P29508 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERPINB3P29508 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERPINB3P29508 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERPINB3P29508 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERPINB3P29508 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERPINB3P29508 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SERPINB3P29508 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SERPINB3P29508 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SERPINB3P29508 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SERPINB3P29508 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SERPINB3P29508 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SERPINB3P29508 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SERPINB3P29508 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SERPINB3P29508 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SERPINB3P29508 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SERPINB3P29508 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SERPINB3P29508 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SERPINB3P29508 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SERPINB3P29508 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SERPINB3P29508 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SERPINB3P29508 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SERPINB3P29508 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SERPINB3P29508 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms