Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms