Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
POLD1P28340 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
POLD1P28340 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
POLD1P28340 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
POLD1P28340 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
POLD1P28340 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
POLD1P28340 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
POLD1P28340 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
POLD1P28340 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
POLD1P28340 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
POLD1P28340 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
POLD1P28340 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
POLD1P28340 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
POLD1P28340 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
POLD1P28340 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
POLD1P28340 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
POLD1P28340 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
POLD1P28340 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
POLD1P28340 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
POLD1P28340 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
POLD1P28340 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
POLD1P28340 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
POLD1P28340 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
POLD1P28340 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
POLD1P28340 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
POLD1P28340 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
POLD1P28340 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
POLD1P28340 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
POLD1P28340 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
POLD1P28340 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
POLD1P28340 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
POLD1P28340 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
POLD1P28340 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
POLD1P28340 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
POLD1P28340 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
POLD1P28340 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
POLD1P28340 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
POLD1P28340 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC19.81■□□□□ 0.76
POLD1P28340 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
POLD1P28340 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
POLD1P28340 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
POLD1P28340 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
POLD1P28340 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
POLD1P28340 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
POLD1P28340 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
POLD1P28340 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
POLD1P28340 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
POLD1P28340 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
POLD1P28340 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
POLD1P28340 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
POLD1P28340 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
POLD1P28340 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
POLD1P28340 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
POLD1P28340 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
POLD1P28340 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
POLD1P28340 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
POLD1P28340 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
POLD1P28340 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
POLD1P28340 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
POLD1P28340 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
POLD1P28340 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
POLD1P28340 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
POLD1P28340 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
POLD1P28340 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
POLD1P28340 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
POLD1P28340 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
POLD1P28340 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
POLD1P28340 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
POLD1P28340 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
POLD1P28340 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
POLD1P28340 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
POLD1P28340 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
POLD1P28340 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
POLD1P28340 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
POLD1P28340 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
POLD1P28340 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
POLD1P28340 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
POLD1P28340 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
POLD1P28340 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
POLD1P28340 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
POLD1P28340 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
POLD1P28340 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
POLD1P28340 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
POLD1P28340 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
POLD1P28340 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
POLD1P28340 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
POLD1P28340 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
POLD1P28340 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
POLD1P28340 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
POLD1P28340 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
POLD1P28340 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
POLD1P28340 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
POLD1P28340 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
POLD1P28340 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
POLD1P28340 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
POLD1P28340 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
POLD1P28340 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
POLD1P28340 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
POLD1P28340 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
POLD1P28340 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.7 ms