Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC14□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC14□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC14□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC14□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms