Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PLNP26678 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PLNP26678 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PLNP26678 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PLNP26678 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PLNP26678 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PLNP26678 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PLNP26678 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PLNP26678 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PLNP26678 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PLNP26678 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PLNP26678 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PLNP26678 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PLNP26678 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PLNP26678 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PLNP26678 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PLNP26678 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
PLNP26678 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PLNP26678 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PLNP26678 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PLNP26678 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PLNP26678 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PLNP26678 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PLNP26678 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PLNP26678 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PLNP26678 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PLNP26678 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PLNP26678 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PLNP26678 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PLNP26678 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PLNP26678 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PLNP26678 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PLNP26678 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PLNP26678 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PLNP26678 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PLNP26678 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PLNP26678 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PLNP26678 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PLNP26678 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PLNP26678 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PLNP26678 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PLNP26678 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PLNP26678 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PLNP26678 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PLNP26678 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PLNP26678 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PLNP26678 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PLNP26678 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PLNP26678 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
PLNP26678 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PLNP26678 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PLNP26678 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
PLNP26678 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PLNP26678 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PLNP26678 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PLNP26678 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PLNP26678 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PLNP26678 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PLNP26678 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PLNP26678 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PLNP26678 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PLNP26678 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PLNP26678 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PLNP26678 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PLNP26678 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PLNP26678 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PLNP26678 LDLRAD4-203ENST00000399848 8633 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PLNP26678 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PLNP26678 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PLNP26678 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PLNP26678 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PLNP26678 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PLNP26678 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PLNP26678 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PLNP26678 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PLNP26678 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PLNP26678 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PLNP26678 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PLNP26678 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
PLNP26678 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PLNP26678 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PLNP26678 PFAS-201ENST00000314666 5371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PLNP26678 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
PLNP26678 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PLNP26678 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PLNP26678 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PLNP26678 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PLNP26678 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PLNP26678 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PLNP26678 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PLNP26678 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PLNP26678 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PLNP26678 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PLNP26678 THAP2-201ENST00000308086 5719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PLNP26678 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PLNP26678 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PLNP26678 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PLNP26678 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
PLNP26678 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PLNP26678 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms