Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DNMT1P26358 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DNMT1P26358 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DNMT1P26358 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DNMT1P26358 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DNMT1P26358 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DNMT1P26358 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DNMT1P26358 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DNMT1P26358 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DNMT1P26358 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DNMT1P26358 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DNMT1P26358 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DNMT1P26358 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DNMT1P26358 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DNMT1P26358 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DNMT1P26358 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DNMT1P26358 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DNMT1P26358 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DNMT1P26358 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
DNMT1P26358 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DNMT1P26358 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
DNMT1P26358 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DNMT1P26358 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
DNMT1P26358 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DNMT1P26358 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DNMT1P26358 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DNMT1P26358 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DNMT1P26358 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DNMT1P26358 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DNMT1P26358 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DNMT1P26358 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DNMT1P26358 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DNMT1P26358 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DNMT1P26358 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DNMT1P26358 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DNMT1P26358 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DNMT1P26358 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
DNMT1P26358 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DNMT1P26358 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DNMT1P26358 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DNMT1P26358 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DNMT1P26358 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
DNMT1P26358 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DNMT1P26358 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DNMT1P26358 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DNMT1P26358 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DNMT1P26358 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
DNMT1P26358 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DNMT1P26358 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DNMT1P26358 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DNMT1P26358 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DNMT1P26358 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DNMT1P26358 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DNMT1P26358 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DNMT1P26358 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
DNMT1P26358 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DNMT1P26358 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DNMT1P26358 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
DNMT1P26358 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
DNMT1P26358 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DNMT1P26358 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
DNMT1P26358 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
DNMT1P26358 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DNMT1P26358 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DNMT1P26358 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DNMT1P26358 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DNMT1P26358 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DNMT1P26358 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DNMT1P26358 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
DNMT1P26358 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DNMT1P26358 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DNMT1P26358 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DNMT1P26358 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DNMT1P26358 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DNMT1P26358 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DNMT1P26358 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DNMT1P26358 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DNMT1P26358 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DNMT1P26358 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DNMT1P26358 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DNMT1P26358 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DNMT1P26358 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DNMT1P26358 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DNMT1P26358 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DNMT1P26358 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DNMT1P26358 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DNMT1P26358 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DNMT1P26358 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DNMT1P26358 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DNMT1P26358 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DNMT1P26358 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
DNMT1P26358 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DNMT1P26358 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DNMT1P26358 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DNMT1P26358 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DNMT1P26358 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DNMT1P26358 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DNMT1P26358 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DNMT1P26358 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DNMT1P26358 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms