Protein–RNA interactions for Protein: P25788

PSMA3, Proteasome subunit alpha type-3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA3P25788 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms