Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms