Protein–RNA interactions for Protein: P19429

TNNI3, Troponin I, cardiac muscle, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3P19429 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms