Protein–RNA interactions for Protein: P18615

NELFE, Negative elongation factor E, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFEP18615 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NELFEP18615 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NELFEP18615 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NELFEP18615 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NELFEP18615 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NELFEP18615 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NELFEP18615 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NELFEP18615 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NELFEP18615 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NELFEP18615 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NELFEP18615 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NELFEP18615 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NELFEP18615 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NELFEP18615 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NELFEP18615 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NELFEP18615 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NELFEP18615 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NELFEP18615 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NELFEP18615 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NELFEP18615 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NELFEP18615 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NELFEP18615 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NELFEP18615 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NELFEP18615 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NELFEP18615 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NELFEP18615 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NELFEP18615 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NELFEP18615 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NELFEP18615 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NELFEP18615 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NELFEP18615 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NELFEP18615 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NELFEP18615 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NELFEP18615 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NELFEP18615 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NELFEP18615 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NELFEP18615 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NELFEP18615 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NELFEP18615 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NELFEP18615 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NELFEP18615 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NELFEP18615 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NELFEP18615 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NELFEP18615 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NELFEP18615 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NELFEP18615 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NELFEP18615 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NELFEP18615 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NELFEP18615 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NELFEP18615 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NELFEP18615 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NELFEP18615 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NELFEP18615 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NELFEP18615 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NELFEP18615 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NELFEP18615 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NELFEP18615 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NELFEP18615 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NELFEP18615 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NELFEP18615 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NELFEP18615 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NELFEP18615 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NELFEP18615 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NELFEP18615 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NELFEP18615 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NELFEP18615 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NELFEP18615 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NELFEP18615 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NELFEP18615 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NELFEP18615 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NELFEP18615 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NELFEP18615 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NELFEP18615 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NELFEP18615 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NELFEP18615 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NELFEP18615 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NELFEP18615 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NELFEP18615 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NELFEP18615 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NELFEP18615 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NELFEP18615 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NELFEP18615 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NELFEP18615 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NELFEP18615 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NELFEP18615 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NELFEP18615 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NELFEP18615 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NELFEP18615 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NELFEP18615 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NELFEP18615 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NELFEP18615 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NELFEP18615 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NELFEP18615 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NELFEP18615 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NELFEP18615 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NELFEP18615 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NELFEP18615 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NELFEP18615 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NELFEP18615 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NELFEP18615 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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