Protein–RNA interactions for Protein: P10645

CHGA, Chromogranin-A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHGAP10645 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHGAP10645 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHGAP10645 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHGAP10645 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHGAP10645 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHGAP10645 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHGAP10645 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHGAP10645 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHGAP10645 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHGAP10645 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHGAP10645 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHGAP10645 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHGAP10645 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHGAP10645 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHGAP10645 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHGAP10645 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHGAP10645 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHGAP10645 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHGAP10645 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHGAP10645 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHGAP10645 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHGAP10645 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHGAP10645 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHGAP10645 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHGAP10645 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHGAP10645 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHGAP10645 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHGAP10645 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHGAP10645 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHGAP10645 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHGAP10645 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHGAP10645 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHGAP10645 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHGAP10645 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CHGAP10645 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHGAP10645 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHGAP10645 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CHGAP10645 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CHGAP10645 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CHGAP10645 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHGAP10645 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHGAP10645 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHGAP10645 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHGAP10645 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHGAP10645 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CHGAP10645 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CHGAP10645 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHGAP10645 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHGAP10645 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHGAP10645 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CHGAP10645 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHGAP10645 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHGAP10645 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHGAP10645 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHGAP10645 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHGAP10645 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHGAP10645 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CHGAP10645 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CHGAP10645 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CHGAP10645 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHGAP10645 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHGAP10645 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHGAP10645 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHGAP10645 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHGAP10645 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHGAP10645 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHGAP10645 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHGAP10645 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHGAP10645 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHGAP10645 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHGAP10645 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHGAP10645 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHGAP10645 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHGAP10645 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CHGAP10645 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CHGAP10645 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHGAP10645 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CHGAP10645 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CHGAP10645 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHGAP10645 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CHGAP10645 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHGAP10645 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHGAP10645 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHGAP10645 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHGAP10645 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHGAP10645 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHGAP10645 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHGAP10645 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHGAP10645 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHGAP10645 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHGAP10645 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHGAP10645 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHGAP10645 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHGAP10645 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHGAP10645 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHGAP10645 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHGAP10645 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHGAP10645 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CHGAP10645 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHGAP10645 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms