Protein–RNA interactions for Protein: P0DO97

CCDC192, Coiled-coil domain-containing protein 192, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC192P0DO97 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC192P0DO97 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC192P0DO97 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC192P0DO97 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC192P0DO97 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC192P0DO97 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC192P0DO97 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC192P0DO97 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC192P0DO97 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC192P0DO97 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC192P0DO97 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC192P0DO97 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC192P0DO97 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC192P0DO97 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC192P0DO97 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC192P0DO97 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC192P0DO97 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC192P0DO97 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC192P0DO97 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC192P0DO97 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC192P0DO97 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC192P0DO97 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC192P0DO97 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC192P0DO97 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC192P0DO97 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC192P0DO97 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC192P0DO97 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC192P0DO97 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC192P0DO97 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC192P0DO97 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC192P0DO97 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC192P0DO97 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC192P0DO97 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC192P0DO97 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC192P0DO97 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC192P0DO97 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC192P0DO97 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC192P0DO97 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC192P0DO97 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC192P0DO97 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC192P0DO97 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC192P0DO97 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC192P0DO97 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC192P0DO97 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC192P0DO97 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC192P0DO97 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC192P0DO97 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC192P0DO97 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC192P0DO97 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC192P0DO97 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC192P0DO97 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC192P0DO97 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC192P0DO97 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC192P0DO97 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC192P0DO97 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC192P0DO97 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC192P0DO97 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC192P0DO97 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC192P0DO97 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC192P0DO97 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC192P0DO97 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC192P0DO97 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC192P0DO97 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC192P0DO97 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC192P0DO97 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC192P0DO97 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC192P0DO97 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC192P0DO97 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC192P0DO97 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC192P0DO97 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC192P0DO97 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC192P0DO97 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC192P0DO97 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC192P0DO97 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC192P0DO97 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC192P0DO97 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC192P0DO97 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC192P0DO97 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC192P0DO97 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC192P0DO97 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CCDC192P0DO97 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CCDC192P0DO97 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CCDC192P0DO97 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CCDC192P0DO97 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CCDC192P0DO97 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CCDC192P0DO97 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CCDC192P0DO97 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CCDC192P0DO97 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CCDC192P0DO97 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CCDC192P0DO97 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms