Protein–RNA interactions for Protein: P0DMW5

SMIM10L2B, Small integral membrane protein 10-like protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM10L2BP0DMW5 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMIM10L2BP0DMW5 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMIM10L2BP0DMW5 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMIM10L2BP0DMW5 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMIM10L2BP0DMW5 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMIM10L2BP0DMW5 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMIM10L2BP0DMW5 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMIM10L2BP0DMW5 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMIM10L2BP0DMW5 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMIM10L2BP0DMW5 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMIM10L2BP0DMW5 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMIM10L2BP0DMW5 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMIM10L2BP0DMW5 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMIM10L2BP0DMW5 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMIM10L2BP0DMW5 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMIM10L2BP0DMW5 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMIM10L2BP0DMW5 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SMIM10L2BP0DMW5 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMIM10L2BP0DMW5 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMIM10L2BP0DMW5 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SMIM10L2BP0DMW5 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMIM10L2BP0DMW5 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMIM10L2BP0DMW5 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMIM10L2BP0DMW5 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMIM10L2BP0DMW5 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMIM10L2BP0DMW5 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMIM10L2BP0DMW5 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMIM10L2BP0DMW5 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SMIM10L2BP0DMW5 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SMIM10L2BP0DMW5 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SMIM10L2BP0DMW5 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMIM10L2BP0DMW5 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMIM10L2BP0DMW5 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMIM10L2BP0DMW5 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMIM10L2BP0DMW5 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMIM10L2BP0DMW5 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMIM10L2BP0DMW5 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMIM10L2BP0DMW5 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMIM10L2BP0DMW5 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMIM10L2BP0DMW5 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMIM10L2BP0DMW5 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMIM10L2BP0DMW5 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMIM10L2BP0DMW5 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMIM10L2BP0DMW5 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMIM10L2BP0DMW5 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMIM10L2BP0DMW5 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMIM10L2BP0DMW5 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMIM10L2BP0DMW5 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMIM10L2BP0DMW5 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMIM10L2BP0DMW5 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMIM10L2BP0DMW5 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMIM10L2BP0DMW5 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMIM10L2BP0DMW5 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMIM10L2BP0DMW5 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMIM10L2BP0DMW5 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SMIM10L2BP0DMW5 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SMIM10L2BP0DMW5 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SMIM10L2BP0DMW5 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMIM10L2BP0DMW5 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMIM10L2BP0DMW5 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMIM10L2BP0DMW5 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMIM10L2BP0DMW5 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMIM10L2BP0DMW5 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMIM10L2BP0DMW5 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMIM10L2BP0DMW5 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMIM10L2BP0DMW5 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SMIM10L2BP0DMW5 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMIM10L2BP0DMW5 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMIM10L2BP0DMW5 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMIM10L2BP0DMW5 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SMIM10L2BP0DMW5 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMIM10L2BP0DMW5 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMIM10L2BP0DMW5 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMIM10L2BP0DMW5 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMIM10L2BP0DMW5 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMIM10L2BP0DMW5 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMIM10L2BP0DMW5 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMIM10L2BP0DMW5 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMIM10L2BP0DMW5 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMIM10L2BP0DMW5 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SMIM10L2BP0DMW5 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMIM10L2BP0DMW5 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMIM10L2BP0DMW5 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMIM10L2BP0DMW5 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMIM10L2BP0DMW5 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMIM10L2BP0DMW5 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMIM10L2BP0DMW5 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMIM10L2BP0DMW5 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMIM10L2BP0DMW5 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SMIM10L2BP0DMW5 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMIM10L2BP0DMW5 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMIM10L2BP0DMW5 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMIM10L2BP0DMW5 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMIM10L2BP0DMW5 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMIM10L2BP0DMW5 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMIM10L2BP0DMW5 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMIM10L2BP0DMW5 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMIM10L2BP0DMW5 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMIM10L2BP0DMW5 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMIM10L2BP0DMW5 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms