Protein–RNA interactions for Protein: P0CW27

CCDC166, Coiled-coil domain-containing protein 166, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC166P0CW27 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms