Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

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Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPRCP08575 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPRCP08575 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPRCP08575 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPRCP08575 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPRCP08575 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPRCP08575 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPRCP08575 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPRCP08575 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPRCP08575 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPRCP08575 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPRCP08575 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPRCP08575 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPRCP08575 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPRCP08575 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPRCP08575 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPRCP08575 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPRCP08575 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPRCP08575 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPRCP08575 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPRCP08575 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPRCP08575 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPRCP08575 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPRCP08575 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPRCP08575 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPRCP08575 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPRCP08575 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPRCP08575 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPRCP08575 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPRCP08575 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPRCP08575 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPRCP08575 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPRCP08575 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPRCP08575 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPRCP08575 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPRCP08575 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPRCP08575 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPRCP08575 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPRCP08575 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPRCP08575 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPRCP08575 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPRCP08575 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPRCP08575 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPRCP08575 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPRCP08575 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPRCP08575 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPRCP08575 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPRCP08575 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPRCP08575 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPRCP08575 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPRCP08575 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPRCP08575 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPRCP08575 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPRCP08575 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPRCP08575 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPRCP08575 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPRCP08575 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPRCP08575 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPRCP08575 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPRCP08575 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPRCP08575 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPRCP08575 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPRCP08575 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPRCP08575 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPRCP08575 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPRCP08575 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPRCP08575 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPRCP08575 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPRCP08575 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPRCP08575 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPRCP08575 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPRCP08575 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPRCP08575 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPRCP08575 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPRCP08575 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPRCP08575 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPRCP08575 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPRCP08575 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPRCP08575 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPRCP08575 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPRCP08575 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPRCP08575 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPRCP08575 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPRCP08575 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPRCP08575 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPRCP08575 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPRCP08575 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPRCP08575 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPRCP08575 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPRCP08575 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
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