Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEFLP07196 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NEFLP07196 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEFLP07196 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEFLP07196 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NEFLP07196 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEFLP07196 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEFLP07196 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEFLP07196 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEFLP07196 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NEFLP07196 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEFLP07196 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEFLP07196 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEFLP07196 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEFLP07196 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEFLP07196 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEFLP07196 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEFLP07196 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEFLP07196 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEFLP07196 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEFLP07196 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEFLP07196 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEFLP07196 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEFLP07196 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEFLP07196 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEFLP07196 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEFLP07196 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEFLP07196 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NEFLP07196 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEFLP07196 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEFLP07196 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEFLP07196 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEFLP07196 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEFLP07196 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEFLP07196 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEFLP07196 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NEFLP07196 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NEFLP07196 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEFLP07196 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEFLP07196 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEFLP07196 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEFLP07196 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEFLP07196 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEFLP07196 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEFLP07196 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEFLP07196 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEFLP07196 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEFLP07196 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NEFLP07196 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEFLP07196 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEFLP07196 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEFLP07196 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEFLP07196 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEFLP07196 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEFLP07196 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEFLP07196 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEFLP07196 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEFLP07196 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEFLP07196 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEFLP07196 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEFLP07196 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NEFLP07196 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEFLP07196 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NEFLP07196 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NEFLP07196 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEFLP07196 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NEFLP07196 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEFLP07196 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEFLP07196 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEFLP07196 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEFLP07196 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEFLP07196 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NEFLP07196 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEFLP07196 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEFLP07196 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEFLP07196 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEFLP07196 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEFLP07196 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEFLP07196 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEFLP07196 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NEFLP07196 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEFLP07196 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEFLP07196 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEFLP07196 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEFLP07196 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEFLP07196 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEFLP07196 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEFLP07196 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEFLP07196 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEFLP07196 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEFLP07196 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEFLP07196 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEFLP07196 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEFLP07196 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEFLP07196 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEFLP07196 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEFLP07196 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEFLP07196 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEFLP07196 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEFLP07196 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms