Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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CLDN9O95484 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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CLDN9O95484 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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CLDN9O95484 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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CLDN9O95484 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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CLDN9O95484 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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CLDN9O95484 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
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CLDN9O95484 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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CLDN9O95484 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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