Protein–RNA interactions for Protein: O60830

TIMM17B, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim17-B, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM17BO60830 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.8 ms