Protein–RNA interactions for Protein: O15205

UBD, Ubiquitin D, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBDO15205 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBDO15205 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBDO15205 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBDO15205 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBDO15205 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBDO15205 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
UBDO15205 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBDO15205 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBDO15205 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBDO15205 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
UBDO15205 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBDO15205 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBDO15205 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBDO15205 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBDO15205 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBDO15205 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBDO15205 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBDO15205 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBDO15205 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBDO15205 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBDO15205 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBDO15205 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBDO15205 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBDO15205 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBDO15205 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBDO15205 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBDO15205 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBDO15205 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBDO15205 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBDO15205 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBDO15205 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBDO15205 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBDO15205 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBDO15205 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBDO15205 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBDO15205 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBDO15205 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBDO15205 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBDO15205 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBDO15205 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBDO15205 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBDO15205 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBDO15205 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBDO15205 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBDO15205 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBDO15205 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
UBDO15205 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBDO15205 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBDO15205 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBDO15205 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBDO15205 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBDO15205 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBDO15205 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBDO15205 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBDO15205 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBDO15205 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBDO15205 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBDO15205 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBDO15205 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
UBDO15205 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBDO15205 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBDO15205 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
UBDO15205 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBDO15205 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
UBDO15205 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
UBDO15205 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
UBDO15205 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
UBDO15205 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
UBDO15205 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBDO15205 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBDO15205 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBDO15205 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBDO15205 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBDO15205 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBDO15205 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBDO15205 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBDO15205 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBDO15205 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBDO15205 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBDO15205 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
UBDO15205 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBDO15205 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBDO15205 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBDO15205 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBDO15205 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBDO15205 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBDO15205 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBDO15205 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBDO15205 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBDO15205 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBDO15205 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBDO15205 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBDO15205 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBDO15205 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBDO15205 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBDO15205 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBDO15205 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBDO15205 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBDO15205 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBDO15205 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms