Protein–RNA interactions for Protein: O15054

KDM6B, Lysine-specific demethylase 6B, humanhuman

Predictions only

Length 1,643 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM6BO15054 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDM6BO15054 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDM6BO15054 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDM6BO15054 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDM6BO15054 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDM6BO15054 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDM6BO15054 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDM6BO15054 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDM6BO15054 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDM6BO15054 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KDM6BO15054 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KDM6BO15054 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
KDM6BO15054 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KDM6BO15054 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KDM6BO15054 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KDM6BO15054 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KDM6BO15054 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KDM6BO15054 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KDM6BO15054 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KDM6BO15054 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
KDM6BO15054 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KDM6BO15054 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KDM6BO15054 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KDM6BO15054 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KDM6BO15054 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KDM6BO15054 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
KDM6BO15054 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KDM6BO15054 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KDM6BO15054 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KDM6BO15054 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KDM6BO15054 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KDM6BO15054 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KDM6BO15054 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KDM6BO15054 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KDM6BO15054 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KDM6BO15054 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KDM6BO15054 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KDM6BO15054 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KDM6BO15054 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KDM6BO15054 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KDM6BO15054 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KDM6BO15054 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KDM6BO15054 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KDM6BO15054 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KDM6BO15054 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KDM6BO15054 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KDM6BO15054 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KDM6BO15054 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
KDM6BO15054 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
KDM6BO15054 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
KDM6BO15054 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
KDM6BO15054 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KDM6BO15054 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
KDM6BO15054 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KDM6BO15054 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KDM6BO15054 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KDM6BO15054 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KDM6BO15054 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KDM6BO15054 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KDM6BO15054 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KDM6BO15054 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
KDM6BO15054 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
KDM6BO15054 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KDM6BO15054 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
KDM6BO15054 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KDM6BO15054 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KDM6BO15054 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KDM6BO15054 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KDM6BO15054 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KDM6BO15054 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KDM6BO15054 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KDM6BO15054 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KDM6BO15054 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KDM6BO15054 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KDM6BO15054 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KDM6BO15054 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
KDM6BO15054 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KDM6BO15054 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KDM6BO15054 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KDM6BO15054 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KDM6BO15054 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
KDM6BO15054 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KDM6BO15054 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
KDM6BO15054 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KDM6BO15054 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KDM6BO15054 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KDM6BO15054 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KDM6BO15054 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KDM6BO15054 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KDM6BO15054 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KDM6BO15054 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KDM6BO15054 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KDM6BO15054 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KDM6BO15054 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KDM6BO15054 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KDM6BO15054 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KDM6BO15054 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KDM6BO15054 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KDM6BO15054 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KDM6BO15054 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms