Protein–RNA interactions for Protein: O14967

CLGN, Calmegin, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLGNO14967 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLGNO14967 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLGNO14967 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLGNO14967 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLGNO14967 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLGNO14967 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLGNO14967 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CLGNO14967 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLGNO14967 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLGNO14967 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLGNO14967 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLGNO14967 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLGNO14967 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLGNO14967 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLGNO14967 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CLGNO14967 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLGNO14967 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLGNO14967 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLGNO14967 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLGNO14967 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CLGNO14967 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CLGNO14967 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CLGNO14967 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLGNO14967 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLGNO14967 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLGNO14967 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLGNO14967 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLGNO14967 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLGNO14967 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLGNO14967 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLGNO14967 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLGNO14967 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CLGNO14967 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CLGNO14967 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLGNO14967 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLGNO14967 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLGNO14967 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLGNO14967 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLGNO14967 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLGNO14967 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLGNO14967 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLGNO14967 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CLGNO14967 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLGNO14967 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLGNO14967 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLGNO14967 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLGNO14967 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLGNO14967 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLGNO14967 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLGNO14967 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLGNO14967 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLGNO14967 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLGNO14967 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLGNO14967 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLGNO14967 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLGNO14967 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLGNO14967 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLGNO14967 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLGNO14967 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLGNO14967 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLGNO14967 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLGNO14967 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLGNO14967 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLGNO14967 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLGNO14967 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLGNO14967 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLGNO14967 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLGNO14967 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLGNO14967 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLGNO14967 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLGNO14967 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLGNO14967 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLGNO14967 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLGNO14967 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLGNO14967 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLGNO14967 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLGNO14967 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLGNO14967 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLGNO14967 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CLGNO14967 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLGNO14967 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLGNO14967 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLGNO14967 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLGNO14967 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLGNO14967 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLGNO14967 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLGNO14967 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLGNO14967 C21orf62-AS1-201ENST00000382375 2453 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLGNO14967 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLGNO14967 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLGNO14967 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLGNO14967 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLGNO14967 ANKZF1-202ENST00000409849 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLGNO14967 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLGNO14967 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLGNO14967 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLGNO14967 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLGNO14967 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLGNO14967 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLGNO14967 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms