Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4K3

TRAF6, TNF receptor-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF6Q9Y4K3 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.1
TRAF6Q9Y4K3 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
TRAF6Q9Y4K3 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
TRAF6Q9Y4K3 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
TRAF6Q9Y4K3 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TRAF6Q9Y4K3 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TRAF6Q9Y4K3 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TRAF6Q9Y4K3 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAF6Q9Y4K3 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAF6Q9Y4K3 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAF6Q9Y4K3 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAF6Q9Y4K3 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAF6Q9Y4K3 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAF6Q9Y4K3 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAF6Q9Y4K3 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAF6Q9Y4K3 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAF6Q9Y4K3 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms