Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D7

PLXND1, Plexin-D1, humanhuman

Predictions only

Length 1,925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXND1Q9Y4D7 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PLXND1Q9Y4D7 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PLXND1Q9Y4D7 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PLXND1Q9Y4D7 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PLXND1Q9Y4D7 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PLXND1Q9Y4D7 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PLXND1Q9Y4D7 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PLXND1Q9Y4D7 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PLXND1Q9Y4D7 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PLXND1Q9Y4D7 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PLXND1Q9Y4D7 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PLXND1Q9Y4D7 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PLXND1Q9Y4D7 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PLXND1Q9Y4D7 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PLXND1Q9Y4D7 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PLXND1Q9Y4D7 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PLXND1Q9Y4D7 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PLXND1Q9Y4D7 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PLXND1Q9Y4D7 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PLXND1Q9Y4D7 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PLXND1Q9Y4D7 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PLXND1Q9Y4D7 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PLXND1Q9Y4D7 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PLXND1Q9Y4D7 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PLXND1Q9Y4D7 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PLXND1Q9Y4D7 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PLXND1Q9Y4D7 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PLXND1Q9Y4D7 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PLXND1Q9Y4D7 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PLXND1Q9Y4D7 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PLXND1Q9Y4D7 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PLXND1Q9Y4D7 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PLXND1Q9Y4D7 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PLXND1Q9Y4D7 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PLXND1Q9Y4D7 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PLXND1Q9Y4D7 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PLXND1Q9Y4D7 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PLXND1Q9Y4D7 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PLXND1Q9Y4D7 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PLXND1Q9Y4D7 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PLXND1Q9Y4D7 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PLXND1Q9Y4D7 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PLXND1Q9Y4D7 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PLXND1Q9Y4D7 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PLXND1Q9Y4D7 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PLXND1Q9Y4D7 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PLXND1Q9Y4D7 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PLXND1Q9Y4D7 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PLXND1Q9Y4D7 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PLXND1Q9Y4D7 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PLXND1Q9Y4D7 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PLXND1Q9Y4D7 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PLXND1Q9Y4D7 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PLXND1Q9Y4D7 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PLXND1Q9Y4D7 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PLXND1Q9Y4D7 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PLXND1Q9Y4D7 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PLXND1Q9Y4D7 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PLXND1Q9Y4D7 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PLXND1Q9Y4D7 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PLXND1Q9Y4D7 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PLXND1Q9Y4D7 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PLXND1Q9Y4D7 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PLXND1Q9Y4D7 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PLXND1Q9Y4D7 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PLXND1Q9Y4D7 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PLXND1Q9Y4D7 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PLXND1Q9Y4D7 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PLXND1Q9Y4D7 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PLXND1Q9Y4D7 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PLXND1Q9Y4D7 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PLXND1Q9Y4D7 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PLXND1Q9Y4D7 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PLXND1Q9Y4D7 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PLXND1Q9Y4D7 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PLXND1Q9Y4D7 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PLXND1Q9Y4D7 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PLXND1Q9Y4D7 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PLXND1Q9Y4D7 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PLXND1Q9Y4D7 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PLXND1Q9Y4D7 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PLXND1Q9Y4D7 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PLXND1Q9Y4D7 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PLXND1Q9Y4D7 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PLXND1Q9Y4D7 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PLXND1Q9Y4D7 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PLXND1Q9Y4D7 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PLXND1Q9Y4D7 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PLXND1Q9Y4D7 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PLXND1Q9Y4D7 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PLXND1Q9Y4D7 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PLXND1Q9Y4D7 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PLXND1Q9Y4D7 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PLXND1Q9Y4D7 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PLXND1Q9Y4D7 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PLXND1Q9Y4D7 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PLXND1Q9Y4D7 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PLXND1Q9Y4D7 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PLXND1Q9Y4D7 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PLXND1Q9Y4D7 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms