Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPY8

MAPRE3, Microtubule-associated protein RP/EB family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAPRE3Q9UPY8 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms