Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms