Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD8

SEPT9, Septin-9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEPT9Q9UHD8 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEPT9Q9UHD8 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEPT9Q9UHD8 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEPT9Q9UHD8 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEPT9Q9UHD8 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEPT9Q9UHD8 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEPT9Q9UHD8 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEPT9Q9UHD8 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SEPT9Q9UHD8 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SEPT9Q9UHD8 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SEPT9Q9UHD8 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SEPT9Q9UHD8 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEPT9Q9UHD8 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SEPT9Q9UHD8 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEPT9Q9UHD8 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEPT9Q9UHD8 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEPT9Q9UHD8 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEPT9Q9UHD8 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEPT9Q9UHD8 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEPT9Q9UHD8 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEPT9Q9UHD8 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEPT9Q9UHD8 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEPT9Q9UHD8 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEPT9Q9UHD8 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEPT9Q9UHD8 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEPT9Q9UHD8 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SEPT9Q9UHD8 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEPT9Q9UHD8 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEPT9Q9UHD8 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEPT9Q9UHD8 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEPT9Q9UHD8 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEPT9Q9UHD8 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEPT9Q9UHD8 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEPT9Q9UHD8 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEPT9Q9UHD8 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SEPT9Q9UHD8 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEPT9Q9UHD8 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEPT9Q9UHD8 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEPT9Q9UHD8 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEPT9Q9UHD8 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEPT9Q9UHD8 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEPT9Q9UHD8 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEPT9Q9UHD8 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEPT9Q9UHD8 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEPT9Q9UHD8 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SEPT9Q9UHD8 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEPT9Q9UHD8 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SEPT9Q9UHD8 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEPT9Q9UHD8 AL158825.2-201ENST00000455336 670 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEPT9Q9UHD8 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEPT9Q9UHD8 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SEPT9Q9UHD8 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEPT9Q9UHD8 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEPT9Q9UHD8 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEPT9Q9UHD8 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEPT9Q9UHD8 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEPT9Q9UHD8 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEPT9Q9UHD8 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEPT9Q9UHD8 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEPT9Q9UHD8 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEPT9Q9UHD8 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEPT9Q9UHD8 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEPT9Q9UHD8 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEPT9Q9UHD8 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEPT9Q9UHD8 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEPT9Q9UHD8 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEPT9Q9UHD8 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEPT9Q9UHD8 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEPT9Q9UHD8 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SEPT9Q9UHD8 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SEPT9Q9UHD8 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SEPT9Q9UHD8 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SEPT9Q9UHD8 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SEPT9Q9UHD8 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SEPT9Q9UHD8 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SEPT9Q9UHD8 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SEPT9Q9UHD8 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SEPT9Q9UHD8 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SEPT9Q9UHD8 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SEPT9Q9UHD8 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SEPT9Q9UHD8 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SEPT9Q9UHD8 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SEPT9Q9UHD8 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SEPT9Q9UHD8 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SEPT9Q9UHD8 CAMTA1-205ENST00000467404 546 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SEPT9Q9UHD8 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SEPT9Q9UHD8 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SEPT9Q9UHD8 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SEPT9Q9UHD8 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SEPT9Q9UHD8 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SEPT9Q9UHD8 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SEPT9Q9UHD8 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SEPT9Q9UHD8 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SEPT9Q9UHD8 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SEPT9Q9UHD8 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SEPT9Q9UHD8 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SEPT9Q9UHD8 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SEPT9Q9UHD8 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SEPT9Q9UHD8 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SEPT9Q9UHD8 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms