Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC1

MLH3, DNA mismatch repair protein Mlh3, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH3Q9UHC1 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MLH3Q9UHC1 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MLH3Q9UHC1 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
MLH3Q9UHC1 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MLH3Q9UHC1 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MLH3Q9UHC1 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MLH3Q9UHC1 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MLH3Q9UHC1 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MLH3Q9UHC1 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MLH3Q9UHC1 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MLH3Q9UHC1 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MLH3Q9UHC1 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MLH3Q9UHC1 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MLH3Q9UHC1 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MLH3Q9UHC1 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
MLH3Q9UHC1 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MLH3Q9UHC1 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MLH3Q9UHC1 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MLH3Q9UHC1 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
MLH3Q9UHC1 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MLH3Q9UHC1 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MLH3Q9UHC1 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
MLH3Q9UHC1 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MLH3Q9UHC1 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MLH3Q9UHC1 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MLH3Q9UHC1 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MLH3Q9UHC1 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MLH3Q9UHC1 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MLH3Q9UHC1 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MLH3Q9UHC1 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MLH3Q9UHC1 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MLH3Q9UHC1 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MLH3Q9UHC1 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MLH3Q9UHC1 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MLH3Q9UHC1 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MLH3Q9UHC1 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MLH3Q9UHC1 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MLH3Q9UHC1 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MLH3Q9UHC1 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MLH3Q9UHC1 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MLH3Q9UHC1 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MLH3Q9UHC1 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MLH3Q9UHC1 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MLH3Q9UHC1 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MLH3Q9UHC1 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MLH3Q9UHC1 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MLH3Q9UHC1 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MLH3Q9UHC1 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
MLH3Q9UHC1 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MLH3Q9UHC1 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MLH3Q9UHC1 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MLH3Q9UHC1 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MLH3Q9UHC1 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MLH3Q9UHC1 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MLH3Q9UHC1 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MLH3Q9UHC1 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MLH3Q9UHC1 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MLH3Q9UHC1 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MLH3Q9UHC1 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MLH3Q9UHC1 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MLH3Q9UHC1 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MLH3Q9UHC1 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MLH3Q9UHC1 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
MLH3Q9UHC1 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MLH3Q9UHC1 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MLH3Q9UHC1 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MLH3Q9UHC1 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MLH3Q9UHC1 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MLH3Q9UHC1 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MLH3Q9UHC1 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MLH3Q9UHC1 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MLH3Q9UHC1 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MLH3Q9UHC1 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MLH3Q9UHC1 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MLH3Q9UHC1 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MLH3Q9UHC1 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MLH3Q9UHC1 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MLH3Q9UHC1 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MLH3Q9UHC1 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
MLH3Q9UHC1 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
MLH3Q9UHC1 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MLH3Q9UHC1 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MLH3Q9UHC1 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
MLH3Q9UHC1 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MLH3Q9UHC1 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MLH3Q9UHC1 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MLH3Q9UHC1 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
MLH3Q9UHC1 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
MLH3Q9UHC1 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
MLH3Q9UHC1 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MLH3Q9UHC1 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MLH3Q9UHC1 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MLH3Q9UHC1 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MLH3Q9UHC1 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MLH3Q9UHC1 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MLH3Q9UHC1 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MLH3Q9UHC1 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MLH3Q9UHC1 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MLH3Q9UHC1 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MLH3Q9UHC1 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms