Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KDM5BQ9UGL1 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
KDM5BQ9UGL1 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KDM5BQ9UGL1 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KDM5BQ9UGL1 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KDM5BQ9UGL1 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KDM5BQ9UGL1 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KDM5BQ9UGL1 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KDM5BQ9UGL1 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KDM5BQ9UGL1 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KDM5BQ9UGL1 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KDM5BQ9UGL1 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
KDM5BQ9UGL1 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
KDM5BQ9UGL1 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KDM5BQ9UGL1 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KDM5BQ9UGL1 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KDM5BQ9UGL1 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
KDM5BQ9UGL1 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
KDM5BQ9UGL1 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
KDM5BQ9UGL1 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
KDM5BQ9UGL1 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KDM5BQ9UGL1 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KDM5BQ9UGL1 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KDM5BQ9UGL1 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KDM5BQ9UGL1 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KDM5BQ9UGL1 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
KDM5BQ9UGL1 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KDM5BQ9UGL1 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KDM5BQ9UGL1 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KDM5BQ9UGL1 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KDM5BQ9UGL1 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KDM5BQ9UGL1 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KDM5BQ9UGL1 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KDM5BQ9UGL1 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KDM5BQ9UGL1 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KDM5BQ9UGL1 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KDM5BQ9UGL1 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KDM5BQ9UGL1 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KDM5BQ9UGL1 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KDM5BQ9UGL1 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KDM5BQ9UGL1 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KDM5BQ9UGL1 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KDM5BQ9UGL1 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KDM5BQ9UGL1 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KDM5BQ9UGL1 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KDM5BQ9UGL1 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KDM5BQ9UGL1 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KDM5BQ9UGL1 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KDM5BQ9UGL1 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
KDM5BQ9UGL1 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KDM5BQ9UGL1 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
KDM5BQ9UGL1 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KDM5BQ9UGL1 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KDM5BQ9UGL1 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
KDM5BQ9UGL1 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KDM5BQ9UGL1 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KDM5BQ9UGL1 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KDM5BQ9UGL1 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KDM5BQ9UGL1 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KDM5BQ9UGL1 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KDM5BQ9UGL1 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KDM5BQ9UGL1 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KDM5BQ9UGL1 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KDM5BQ9UGL1 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KDM5BQ9UGL1 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KDM5BQ9UGL1 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KDM5BQ9UGL1 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KDM5BQ9UGL1 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
KDM5BQ9UGL1 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KDM5BQ9UGL1 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KDM5BQ9UGL1 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KDM5BQ9UGL1 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KDM5BQ9UGL1 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KDM5BQ9UGL1 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KDM5BQ9UGL1 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KDM5BQ9UGL1 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KDM5BQ9UGL1 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KDM5BQ9UGL1 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KDM5BQ9UGL1 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KDM5BQ9UGL1 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KDM5BQ9UGL1 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KDM5BQ9UGL1 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KDM5BQ9UGL1 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
KDM5BQ9UGL1 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KDM5BQ9UGL1 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KDM5BQ9UGL1 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KDM5BQ9UGL1 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KDM5BQ9UGL1 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KDM5BQ9UGL1 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KDM5BQ9UGL1 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KDM5BQ9UGL1 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KDM5BQ9UGL1 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KDM5BQ9UGL1 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KDM5BQ9UGL1 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KDM5BQ9UGL1 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KDM5BQ9UGL1 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KDM5BQ9UGL1 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KDM5BQ9UGL1 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KDM5BQ9UGL1 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KDM5BQ9UGL1 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms