Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT7

CTNNAL1, Alpha-catulin, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNAL1Q9UBT7 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms