Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CHPF2Q9P2E5 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CHPF2Q9P2E5 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CHPF2Q9P2E5 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CHPF2Q9P2E5 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CHPF2Q9P2E5 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHPF2Q9P2E5 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHPF2Q9P2E5 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHPF2Q9P2E5 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHPF2Q9P2E5 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CHPF2Q9P2E5 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHPF2Q9P2E5 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHPF2Q9P2E5 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHPF2Q9P2E5 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHPF2Q9P2E5 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHPF2Q9P2E5 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHPF2Q9P2E5 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHPF2Q9P2E5 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHPF2Q9P2E5 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHPF2Q9P2E5 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHPF2Q9P2E5 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHPF2Q9P2E5 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHPF2Q9P2E5 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHPF2Q9P2E5 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHPF2Q9P2E5 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHPF2Q9P2E5 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHPF2Q9P2E5 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHPF2Q9P2E5 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHPF2Q9P2E5 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHPF2Q9P2E5 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHPF2Q9P2E5 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHPF2Q9P2E5 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHPF2Q9P2E5 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHPF2Q9P2E5 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHPF2Q9P2E5 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHPF2Q9P2E5 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CHPF2Q9P2E5 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHPF2Q9P2E5 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHPF2Q9P2E5 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHPF2Q9P2E5 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHPF2Q9P2E5 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHPF2Q9P2E5 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHPF2Q9P2E5 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHPF2Q9P2E5 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CHPF2Q9P2E5 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHPF2Q9P2E5 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHPF2Q9P2E5 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHPF2Q9P2E5 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHPF2Q9P2E5 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHPF2Q9P2E5 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHPF2Q9P2E5 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHPF2Q9P2E5 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHPF2Q9P2E5 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHPF2Q9P2E5 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHPF2Q9P2E5 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHPF2Q9P2E5 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHPF2Q9P2E5 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHPF2Q9P2E5 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHPF2Q9P2E5 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CHPF2Q9P2E5 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHPF2Q9P2E5 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHPF2Q9P2E5 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CHPF2Q9P2E5 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHPF2Q9P2E5 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHPF2Q9P2E5 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHPF2Q9P2E5 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHPF2Q9P2E5 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHPF2Q9P2E5 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHPF2Q9P2E5 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHPF2Q9P2E5 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CHPF2Q9P2E5 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHPF2Q9P2E5 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHPF2Q9P2E5 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHPF2Q9P2E5 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHPF2Q9P2E5 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHPF2Q9P2E5 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHPF2Q9P2E5 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHPF2Q9P2E5 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHPF2Q9P2E5 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHPF2Q9P2E5 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHPF2Q9P2E5 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHPF2Q9P2E5 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHPF2Q9P2E5 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHPF2Q9P2E5 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHPF2Q9P2E5 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHPF2Q9P2E5 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHPF2Q9P2E5 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHPF2Q9P2E5 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHPF2Q9P2E5 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHPF2Q9P2E5 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHPF2Q9P2E5 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHPF2Q9P2E5 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHPF2Q9P2E5 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHPF2Q9P2E5 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHPF2Q9P2E5 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHPF2Q9P2E5 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHPF2Q9P2E5 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHPF2Q9P2E5 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHPF2Q9P2E5 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHPF2Q9P2E5 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms