Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW5

CLN6, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 6, humanhuman

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN6Q9NWW5 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CLN6Q9NWW5 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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