Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW1

RAB6B, Ras-related protein Rab-6B, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6BQ9NRW1 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms