Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms