Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms