Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP90

RAB9B, Ras-related protein Rab-9B, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB9BQ9NP90 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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RAB9BQ9NP90 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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RAB9BQ9NP90 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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