Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARFGAP3Q9NP61 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARFGAP3Q9NP61 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARFGAP3Q9NP61 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARFGAP3Q9NP61 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARFGAP3Q9NP61 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARFGAP3Q9NP61 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARFGAP3Q9NP61 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARFGAP3Q9NP61 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARFGAP3Q9NP61 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARFGAP3Q9NP61 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ARFGAP3Q9NP61 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARFGAP3Q9NP61 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARFGAP3Q9NP61 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARFGAP3Q9NP61 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARFGAP3Q9NP61 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ARFGAP3Q9NP61 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ARFGAP3Q9NP61 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ARFGAP3Q9NP61 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ARFGAP3Q9NP61 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ARFGAP3Q9NP61 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ARFGAP3Q9NP61 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ARFGAP3Q9NP61 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ARFGAP3Q9NP61 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ARFGAP3Q9NP61 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ARFGAP3Q9NP61 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ARFGAP3Q9NP61 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ARFGAP3Q9NP61 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ARFGAP3Q9NP61 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ARFGAP3Q9NP61 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
ARFGAP3Q9NP61 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ARFGAP3Q9NP61 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ARFGAP3Q9NP61 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ARFGAP3Q9NP61 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ARFGAP3Q9NP61 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ARFGAP3Q9NP61 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ARFGAP3Q9NP61 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ARFGAP3Q9NP61 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ARFGAP3Q9NP61 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ARFGAP3Q9NP61 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ARFGAP3Q9NP61 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ARFGAP3Q9NP61 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ARFGAP3Q9NP61 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ARFGAP3Q9NP61 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ARFGAP3Q9NP61 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ARFGAP3Q9NP61 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ARFGAP3Q9NP61 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ARFGAP3Q9NP61 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ARFGAP3Q9NP61 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ARFGAP3Q9NP61 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ARFGAP3Q9NP61 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ARFGAP3Q9NP61 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ARFGAP3Q9NP61 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ARFGAP3Q9NP61 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ARFGAP3Q9NP61 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ARFGAP3Q9NP61 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ARFGAP3Q9NP61 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARFGAP3Q9NP61 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ARFGAP3Q9NP61 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARFGAP3Q9NP61 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARFGAP3Q9NP61 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARFGAP3Q9NP61 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARFGAP3Q9NP61 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ARFGAP3Q9NP61 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARFGAP3Q9NP61 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARFGAP3Q9NP61 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARFGAP3Q9NP61 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARFGAP3Q9NP61 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARFGAP3Q9NP61 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARFGAP3Q9NP61 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARFGAP3Q9NP61 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARFGAP3Q9NP61 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARFGAP3Q9NP61 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARFGAP3Q9NP61 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARFGAP3Q9NP61 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARFGAP3Q9NP61 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARFGAP3Q9NP61 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARFGAP3Q9NP61 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ARFGAP3Q9NP61 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARFGAP3Q9NP61 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ARFGAP3Q9NP61 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARFGAP3Q9NP61 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARFGAP3Q9NP61 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ARFGAP3Q9NP61 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARFGAP3Q9NP61 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARFGAP3Q9NP61 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARFGAP3Q9NP61 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARFGAP3Q9NP61 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARFGAP3Q9NP61 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARFGAP3Q9NP61 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARFGAP3Q9NP61 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARFGAP3Q9NP61 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARFGAP3Q9NP61 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARFGAP3Q9NP61 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARFGAP3Q9NP61 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARFGAP3Q9NP61 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARFGAP3Q9NP61 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARFGAP3Q9NP61 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARFGAP3Q9NP61 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARFGAP3Q9NP61 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms